Berikut adalah beberapa prestasi yang telah diraih KPPBC TMP Ngurah Rai:
- Meraih Predikat Kantor Pelayanan Terbaik (KPT) tingkat Kementerian Keuangan pada Tahun 2022
- Meraih Predikat Kantor Pengelola Arsip Terbaik (KPAT) di Direktorat Jenderal Bea dan Cukai Tahun 2022
- Juara 1 Sayembara Event PLI Se-Bea Cukai dengan Pelaksanaan Kegiatan “Bea Cukai Menyapa Dunia” pada Tahun 2022
- Juara 1 PUG Se-Kementerian Keuangan pada tahun 2021
- WCO Certificate of Merit atas inovasi aplikasi E-CD (Electronic Customs Declaration) pada Tahun 2021
- Meraih Predikat Wilayah Birokrasi Bersih dan Melayani pada Tahun 2020
- Meraih Predikat “Sangat Baik” Evaluasi Unit Pelayanan Publik Tahun 2019 pada Tahun 2020
- Meraih Predikat Wilayah Bebas dari Korupsi pada tahun 2019
- Meraih ISO 9001 : 2015
- Bandara peringkat 3 terbaik di dunia versi ACI (Airport Council International)
- Sukses mengawal pelaksanaan event-event besar berskala internasional
- Penghargaan dari PT Bank Mandiri (Persero) Tbk atas Kontribusi dalam mendukung program Cashless Society untuk Pembayaran Penerimaan Negara Tahun 2019
- Penghargaan dari PT Trakindo Utama atas Pelayanan Prima Customs Clearance dengan Fasilitas Rush Handling Tahun 2019
- Apresiasi dari PT Angkasa Pura I (Persero) atas Kerjasama serta Dukungannya sehingga Bandar Udara Internasional I Gusti Ngurah Rai Bali berhasil meraih Award Airport Service Quality ACI di 3 Kategori Tahun 2019
- Penghargaan dari Yayasan Bali Rastiti Bhakti atas Pelayanan yang diberikan kepada Yayasan Bali Rastiti Bhakti Tahun 2019
- Penghargaan dari Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi RI sebagai unit kerja memenuhi kriteria Wilayah Bebas dari Korupsi (WBK) Tahun 2018
- Penghargaan dari Menteri Keuangan RI sebagai unit kerja memenuhi kriteria Wilayah Bebas dari Korupsi (WBK) di Lingkungan Kementerian Keuangan Tahun 2018
- Penghargaan dari PT Inti Dufree Promosindo atas Dedikasi Bea Cukai Ngurah Rai dalam Pelaksanaan Tugas dan Pelayanan Profesional tahun 2018
- Penghargaan dari PT Dufrindo Internasional atas Pelayanan Prima dengan Fasilitas Toko Bebas Bea tahun 2018
- Penghargaan dari Lanud I Gusti Ngurah Rai atas Kerjasama yang Baik dalam Penyelenggaraan Rangkaian Kegiatan Hari Bhakti TNI AU ke-70 di Desa Busungbiu Tahun 2017
- Penghargaan dari Politeknik Negeri Bali atas Kerjasama dalam Menyukseskan Program “Link and Match” dalam bentuk Praktik Kerja Lapangan (PKL) Mahasiswa Jurusan Akuntansi Politeknik Negeri Bali (PNB) Tahun 2017
- Penghargaan dari PT Trakindo Utama atas Pelayanan Prima Customs Clearance dengan PIB Berkala Tahun 2016
- Penghargaan dari PT Newmont Nusa Tenggara atas Pelayanan Paripurna dalam Pengawasan Barang Ekspor dan Impor bagi Proyek Tambang Tembaga Emas Batu Hijau di Sumbawa Barat Tahun 2016
- Penghargaan dari Gudang Berikat PT Aerofood Indonesia atas Pelayanan Prima yang telah diberikan kepada Aerofood ACS dalam hal penyelesaian Custom Clearance Tahun 2016
- Penghargaan dari Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi RI dalam Evaluasi Unit Pelayanan Publik Tahun 2019 berpredikat Sangat Baik (tertinggi se-Kementerian Keuangan)
- Penghargaan dari Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi RI sebagai unit kerja memenuhi kriteria Wilayah Birokrasi Bersih dan Melayani Tahun 2019
- Juara 1 Penerapan Pengarusutamaan Gender se-Kementerian Keuangan Tahun 2021
- Penghargaan dari Universitas Udayana atas pelayanan optimal bagi pembebasan bea masuk dan cukai atas impor barang untuk keperluan penelitian dan pengembangan ilmu pengetahuan